- Částicová a jaderná fyzika🇨🇿 NMgr. | Matematicko-fyzikální fakulta
- Mezinárodní magistr v ekonomii, politice a společnosti se specializací Politika a bezpečnost🇬🇧 NMgr. | Fakulta sociálních věd
- Teritoriální studia se specializací Balkánská, euroasijská a středoevropská studia🇨🇿 NMgr. | Fakulta sociálních věd
- Teritoriální studia se specializací Evropská studia🇨🇿 NMgr. | Fakulta sociálních věd
- Teritoriální studia se specializací Německá a rakouská studia🇨🇿 NMgr. | Fakulta sociálních věd
- Teritoriální studia se specializací Severoamerická studia🇨🇿 NMgr. | Fakulta sociálních věd
- Teritoriální studia se specializací Západoevropská studia🇨🇿 NMgr. | Fakulta sociálních věd
- Teritoriální studia🇬🇧 NMgr. | Fakulta sociálních věd
- Sociální práce🇨🇿 NMgr. | Filozofická fakulta
- Balkánská, euroasijská a středoevropská studia se specializací Ruská a eurasijská studia🇬🇧 NMgr. | Fakulta sociálních věd
- Balkánská, euroasijská a středoevropská studia se specializací Balkánská a středoevropská studia🇬🇧 NMgr. | Fakulta sociálních věd
- Mezinárodní magistr v ekonomii, politice a společnosti se specializací Historie a společnost🇬🇧 NMgr. | Fakulta sociálních věd
- Finance and Data Analytics🇬🇧 NMgr. | Fakulta sociálních věd
- Německý jazyk se zaměřením na vzdělávání🇨🇿 Bc. | Pedagogická fakulta
- Ekonomický výzkum🇨🇿 NMgr. | Fakulta sociálních věd
- Matematické a počítačové modelování ve fyzice🇨🇿 NMgr. | Matematicko-fyzikální fakulta
- Teoretická fyzika🇨🇿 NMgr. | Matematicko-fyzikální fakulta
- European Politics and Society: Vaclav Havel Joint Master Programme🇬🇧 NMgr. | Fakulta sociálních věd
- Mezinárodní magistr v ekonomii, politice a společnosti se specializací Politika a mezinárodní ekonomika se zaměřením na ekonomiku🇬🇧 NMgr. | Fakulta sociálních věd
- Právo a právní věda🇨🇿 Mgr. | Právnická fakulta
- Historie a teritoriální studia🇬🇧 Bc. | Fakulta sociálních věd
- Sociální vědy🇬🇧 Bc. | Fakulta sociálních věd
- Politologie, filosofie a ekonomie🇬🇧 Bc. | Fakulta sociálních věd
- Teritoriální studia se specializací Teritoriální studia🇨🇿 Bc. | Fakulta sociálních věd
- Molekulární biologie a biochemie organismů🇨🇿 Bc. | Přírodovědecká fakulta
- Ekologická a evoluční biologie🇨🇿 Bc. | Přírodovědecká fakulta
- Bioinformatika🇨🇿 Bc. | Přírodovědecká fakulta
- Biologie🇨🇿 Bc. | Přírodovědecká fakulta