- Studia nových médií🇨🇿 NMgr. | Filozofická fakulta
- Politologie a mezinárodní vztahy🇨🇿 Bc. | Fakulta sociálních věd
- Fyzika povrchů a plazmatu🇨🇿 NMgr. | Matematicko-fyzikální fakulta
- Praktická geobiologie🇨🇿 Bc. | Přírodovědecká fakulta
- Ochrana životního prostředí🇨🇿 NMgr. | Přírodovědecká fakulta
- Sociální geografie a regionální rozvoj +1🇨🇿 NMgr. | Přírodovědecká fakulta
- European Politics and Society: Vaclav Havel Joint Master Programme🇬🇧 NMgr. | Fakulta sociálních věd
- Učitelství náboženství a základů společenských věd pro střední školy🇨🇿 NMgr. | Husitská teologická fakulta
- Krajina a společnost🇨🇿 NMgr. | Přírodovědecká fakulta
- Právo a právní věda🇨🇿 Mgr. | Právnická fakulta
- Vědy o Zemi🇨🇿 Bc. | Přírodovědecká fakulta
- Fyzika kondenzovaných soustav a materiálů🇨🇿 NMgr. | Matematicko-fyzikální fakulta
- Dějiny křesťanského umění🇨🇿 Bc. | Katolická teologická fakulta
- Dějiny evropské kultury +1🇨🇿 Bc. | Katolická teologická fakulta
- Katolická teologie🇨🇿 Mgr. | Katolická teologická fakulta
- Fyzika atmosféry, meteorologie a klimatologie🇨🇿 NMgr. | Matematicko-fyzikální fakulta
- Sociologie se specializací Socioekonomická studia🇨🇿 Bc. | Filozofická fakulta
- Sociology of Contemporary Societies with specialisation in Anthropology of Space and Mobility🇬🇧 NMgr. | Fakulta sociálních věd
- Hospodaření s přírodními zdroji🇨🇿 Bc. | Přírodovědecká fakulta