- Ke vztahu vědy a náboženství1996 | Matematicko-fyzikální fakulta
- Mezi teologií a religionistikou : věda o náboženství v pojetí Wilfreda Cantwella Smithe2007 | Evangelická teologická fakulta
- Na počátku všech věcí. Přírodní vědy a náboženství2011 | Filozofická fakulta
- Připustit, že by to mohlo být jinak : Josef Potoček: Mýtus evoluce: co je základem našeho života: evoluce, nebo stvoření? Mělník: Juda 20202020 | Publikace bez příslušnosti k fakultě
- Aut Moses, aut Darwin?2009 | Filozofická fakulta, Přírodovědecká fakulta
- Otec velkého třesku: Georges Lemaître - střídmý kosmolog, jemuž nestačila slova2019 | Publikace bez příslušnosti k fakultě
- Vědecká racionalita a současné přístupy k transcendenci2010 | Pedagogická fakulta
- Mezi vědou a ideologií : recepce Darwina a darwinismu v českých zemích v letech 1859-19592008 | Přírodovědecká fakulta
- Prolog: jednota jako etický princip poznání2013 | Publikace bez příslušnosti k fakultě
- Slovo, na kterém záleží. Etika jako první filosofie u Emmanuela Lévinase2013 | Publikace bez příslušnosti k fakultě
- Úvahy a studie Zdeňka Neubauera o náboženství a vědě z let 1979-1983: ediční komentář2019 | Přírodovědecká fakulta
- Patočkova raná filosofie umění2016 | Filozofická fakulta
- Filosofická víra podle Karla Jasperse2017 | Filozofická fakulta
- Využití Whitehousovy teorie modů religiozity k výzkumu rituálu večerní šabatové bohoslužby2021 | Husitská teologická fakulta